科学网鱼类中套式病毒并不罕见

    据中国疾控中心病毒病所提供的消息，6月14日和15日、17日，中国疾控中心病毒病所工作人员先后3次进入新发地农产品批发市场，并曾经在一整条三文鱼的口腔拭子中检测到新冠病毒。从病毒的基因组分析来看，病毒更接近新冠病毒欧洲流行株，但是它比现在欧洲流行的病毒株要更古老。

三文鱼嘴里的病毒是哪里来的暂且放下不说，那么分割三文鱼的砧板上的病毒就很可能来自于三文鱼本身了。但是，三文鱼细胞上并不含有与哺乳动物高度同源的ACE2受体，是不会感染新冠病毒的，所以，还是将目标投向环境污染，如养殖海水污染、冷冻用冰块污染等等。

但是也有朋友说，前几天看到一篇文献解读，说三文鱼会感染一种太平洋鲑套式病毒Pacific salmon nidovirus (PsNV)，这种病毒与冠状病毒有相似之处，所以认为“三文鱼或可感染新冠病毒”。因为碰巧在河蟹中发现过类似的套式病毒，所以也算是对套式病毒有所了解，根据NCBI基因组分类，PsNV并未划分在冠状病毒科，与冠状病毒科的同源性大约在30%以下，与新冠病毒所在的属亲缘关系更远一些。这种相似性与新冠病毒及SARS的不同毒株彼此间同源性在90%左右甚至更高完全不一样。
    2018年ICTV调整了套式病毒目的分类，在冠状病毒科(Coronaviridae)、动脉炎病毒科(Arteriviridae)、杆套病毒科(Roniviridae)基础上新增了Abyssoviridae、Medioniviridae、Mononiviridae、Euroniviridae和Tobaniviridae等5个病毒科，此外尚有多个新的特殊分类待定。

实际上，鱼类中还是广泛存在这类套式病毒的，而且分属于不同的科属，表现出丰富的多样性。如太平洋鲑套式病毒Pacific salmon nidovirus 、大鳞大麻哈鱼套式病毒Chinook salmon nidovirus（Tobaniviridae病毒科）、肥头鲤套式病毒Fathead minnow nidovirus、白鳊套式病毒White bream nidovirus（Bafinivirus鳊鱼病毒属，Tobaniviridae，原Torovirinae环曲病毒亚科），黄颡鱼冠状病毒yellow catfish bafinivirus、鲫鱼冠状病毒Crucian Carp Bafinivirus等等。这些病毒，不仅基因组相似性与新冠病毒差别很大，而且形态也不一样，其中不少为短杆状而非球型。套式病毒在昆虫、甲壳动物、爬行动物中也有广泛的分布。

    目前国内已有几个单位开展有相关研究，我也有初步发现，在此就不再多叙。借用一下文献中的进化树看看鱼类套式病毒之间的亲缘关系：